Krankenhaussoftware und Kliniksoftware umfasst in der Regel ein Patientendatenmanagement. Sie bietet die Möglichkeit zur Führung von virtuellen Patientenakten und kann sowohl Module für Stationsarbeitsplätze, Arztarbeitsplätze und Pflegearbeitsplätze enthalten. Die Software für Krankenhäuser und Kliniken erlaubt meist Befundkommunikation und Terminmanagement. Sie beinhaltet z.B. Module für das OP-Management, die medizinische Fachdokumentation, Wunddokumentation und die Arztbriefschreibung. Ebenso lassen sich oft die Planung von z.B. Funktionsdiagnostik, Dialyse oder Chemotherapie mit der Software gestalten.